就在几名嫌疑人争执中，柯南终于破解了乐谱中的秘密，连接起来，那就是：业障之火的恨，就在此昭雪……
村中的几人听后大为震惊，业障之火的恨？难道是12年前引火**的麻生圭二怨念未了？甚至大家推断，麻生圭二还活着！？
可村中的警察却肯定的告诉大家，麻生圭二已经死于那场大火之中，火后，还留下了他与妻女的遗骸，包括房间里的东西，都被焚毁了，只有保险柜，留下的一张手写的乐谱，保存完好。
目暮警官立刻命令这名警察，去将那张乐谱取回来！
柯南也跟着跑了上去。
路上，柯南问村中的警察，12年前，真的是麻生圭二自己放的火，烧了自己的家吗？
警察告诉柯南，目击者是这么说的，当时的目击者共有四个人，分别是前任村长、川岛英夫、黑岩村长以及西本四人……
柯南很奇怪，因为除了西本先生外，剩下的四人全部死了。
村中驻守警察告诉柯南，这四人，从小都是和麻生圭二先生一起长大的，彼此是儿时的玩伴，还经常五人一起相约去学钢琴。
老警察找到了那张乐谱，小兰这时急匆匆的跑来，告诉柯南不必着急赶回去了，因为警方已经让那些人各自回家了，因为这是座孤岛，反正也没有人能够逃出去。
可柯南却一下子急了，让来警察立刻带着他和小兰赶回社区活动中心，就在这里，柯南发现了神秘的黑衣人，以及倒地的黑岩村长女婿，村泽先生。
黑衣人破窗而逃了，这时，柯南发现了小兰发出的尖叫，急忙跑了过去。
原来在仓库里，西本先生被人吊死在那儿，同时，房间里还有收音机，以及一张乐谱，上边还留下了“遗书”两个字。
小兰推断，难道之前的凶杀案，都是西本先生做的？
目暮警官和毛利小五郎赶来后，也倾向于西本先生是自杀，只有柯南大声提醒几人，西本先生并不是自杀，而是他杀！
因为被害现场，上吊的西本先生脚下并没有任何垫脚的东西，又是怎样悬空，将自己吊在绳子上的？
可凶手为什么要留下这种破绽百出的线索呢？
另一边。
黑岩村长女婿村泽先生，虽然昏了过去，还好并没有性命之忧。
从村泽先生的身边，柯南发现了一个钢琴的调音工具，随后柯南回想着那名逃走黑衣人的举动，似乎是在钢琴底摸索，似乎在寻找什么东西。
柯南摸索后发现，在钢琴底似乎有一个口子，里面洒落下来的粉末，经过柯南的确认，应该是……毒品！
警方将嫌疑人召集起来问话，柯南意外的发现秘书平田先生手腕受伤了，袖子上还占有一些白白的粉末。
刻意提醒对方后，大惊失色的平田先生从钱包里掉出了许多国外的钱币。
随后，柯南又将案情梳理了一遍，然后在麻生圭二留下的乐谱线索中，找到了他留下的暗号：写给我的儿子“玉中”……
老警察告诉柯南，麻生圭二先生除了女儿之外，还有一个儿子，因为小时候患了一场大病，一直住在医院中治疗，而他儿子的名字，就叫……“玉中”。
柯南听到了这里，像是被一道闪电划过了脑海，回想起这一幕幕的杀人案件：难道，凶手是……